Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcn1E9PVA8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcn1E9PVA8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcn1E9PVA8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcn1E9PVA8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcn1E9PVA8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcn1E9PVA8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcn1E9PVA8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcn1E9PVA8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcn1E9PVA8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcn1E9PVA8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcn1E9PVA8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcn1E9PVA8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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