Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms