Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cngb1E1AZ71 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms