Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC035044E0CXF8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms