Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Defa28D3Z1V9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Defa28D3Z1V9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa28D3Z1V9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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