Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms