Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6685D3YYP3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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