Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms