Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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