Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms