Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms