Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms