Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip3B9EHT4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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