Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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