Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms