Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cfap58B2RW38 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms