Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpb1B2RS76 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpb1B2RS76 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpb1B2RS76 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpb1B2RS76 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpb1B2RS76 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpb1B2RS76 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpb1B2RS76 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms