Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms