Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms