Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud3B1AZ99 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms