Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2uB1AUC4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2uB1AUC4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2uB1AUC4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2uB1AUC4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2uB1AUC4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2uB1AUC4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2uB1AUC4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2uB1AUC4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2uB1AUC4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2uB1AUC4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2uB1AUC4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms