Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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