Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms