Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M5A7VMS3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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