Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms