Protein–RNA interactions for Protein: A2BFE8

Prrg1, Proline-rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrg1A2BFE8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prrg1A2BFE8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrg1A2BFE8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms