Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms