Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Frmpd1A2AKB4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms