Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc4a11A2AJN7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc4a11A2AJN7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc4a11A2AJN7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc4a11A2AJN7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc4a11A2AJN7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc4a11A2AJN7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc4a11A2AJN7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc4a11A2AJN7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc4a11A2AJN7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc4a11A2AJN7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc4a11A2AJN7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc4a11A2AJN7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc4a11A2AJN7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc4a11A2AJN7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms