Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lcn6A2AJB9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Lcn6A2AJB9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Lcn6A2AJB9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Lcn6A2AJB9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Lcn6A2AJB9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Lcn6A2AJB9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Lcn6A2AJB9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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