Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms