Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf2A2A5Z6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms