Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm27029A2A4P4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms