Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms