Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVR5

Rasgef1a, RasGEF domain family, member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms