Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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