Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms