Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM63Q969Q1 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms