Protein–RNA interactions for Protein: Q71U36

TUBA1A, Tubulin alpha-1A chain, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1AQ71U36 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA1AQ71U36 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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TUBA1AQ71U36 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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TUBA1AQ71U36 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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TUBA1AQ71U36 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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TUBA1AQ71U36 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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TUBA1AQ71U36 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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TUBA1AQ71U36 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA1AQ71U36 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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