Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms