Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms