Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VAMP3Q15836 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VAMP3Q15836 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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