Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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