Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC-0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERC1Q15751 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms