Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.9 ms