Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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TCIRG1Q13488 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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TCIRG1Q13488 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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TCIRG1Q13488 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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TCIRG1Q13488 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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TCIRG1Q13488 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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TCIRG1Q13488 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
TCIRG1Q13488 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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TCIRG1Q13488 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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TCIRG1Q13488 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCIRG1Q13488 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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