Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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FOXF1Q12946 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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FOXF1Q12946 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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FOXF1Q12946 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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FOXF1Q12946 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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