Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA4DQ92854 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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