Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
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SP6Q3SY56 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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SP6Q3SY56 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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SP6Q3SY56 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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SP6Q3SY56 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SP6Q3SY56 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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