Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.1 ms